home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00675 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  32 lines
  1. ****************************
  2. * Calsequestrin signatures *
  3. ****************************
  4.  
  5. Calsequestrin is   a  moderate-affinity, high-capacity calcium-binding protein
  6. of cardiac  and  skeletal muscle [1], where it is located in the lumenal space
  7. of the  sarcoplasmic  reticulum  terminal  cisternae.  Calsequestrin acts as a
  8. calcium  buffer  and  plays  an important   role  in  the  muscle  excitation-
  9. contraction coupling.  It  is  a highly acidic protein of about 400 amino acid
  10. residues that  binds  more than 40 moles of calcium per mole of protein. There
  11. are at  least two different forms of calsequestrin: one which is expressed  in
  12. cardiac muscles  and  another  in  skeletal  muscles.  Both  forms have highly
  13. similar sequences.
  14.  
  15. We have developed two signature sequences, the first one corresponds to the N-
  16. terminus of  the  mature  protein;  the second is located just in front of the
  17. C-terminus  of  the  protein  which is  composed  of  a  highly acidic tail of
  18. variable length.
  19.  
  20. -Consensus pattern: [EQ]-[DE]-G-L-[DN]-F-P-x-Y-D-G-x-D-R-V
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23.  
  24. -Consensus pattern: [DE]-L-E-D-W-[LIVM]-E-D-V-L-x-G-x-[LIVM]-N-T-E-D-D-D
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27.  
  28. -Last update: October 1993 / First entry.
  29.  
  30. [ 1] Treves S., Vilsen B., Chiozzi P., Andersen J.P., Zorzato F.
  31.      Biochem. J. 283:767-772(1992).
  32.